Index

A

align_evaporation_field() (in module apyt.reconstruction.basic) apyt.analysis module apyt.analysis.chemistry module apyt.analysis.chemistry.locomp module apyt.analysis.crystallography module apyt.analysis.crystallography.sdm module apyt.analysis.spectrum module apyt.gui module apyt.gui.forms module apyt.io module

apyt.io.config module apyt.io.conv module apyt.io.localdb module apyt.io.sql module apyt.reconstruction module apyt.reconstruction.basic module apyt.reconstruction.non_spherical module apyt.spectrum module apyt.spectrum.align module apyt.spectrum.fit module

C

calc_stats() (in module apyt.analysis.chemistry.locomp) check_compatibility() (in module apyt.spectrum.fit) check_periodic_box() (in module apyt.analysis.chemistry.locomp)

correlation() (in module apyt.analysis.spectrum) counts() (in module apyt.spectrum.fit) CurvatureReconstructor (class in apyt.reconstruction.non_spherical)

D

debug_plot() (apyt.reconstruction.non_spherical.CurvatureReconstructor method) download() (in module apyt.io.localdb) (in module apyt.io.sql)

dump_record() (in module apyt.io.sql)

E

emulate_efficiency() (in module apyt.analysis.chemistry.locomp) enable_debug() (in module apyt.reconstruction.basic) (in module apyt.spectrum.align) (in module apyt.spectrum.fit)

epos_to_raw() (in module apyt.io.conv)

F

fit() (in module apyt.spectrum.fit)

G

get_composition() (in module apyt.analysis.chemistry.locomp) get_evaporation_field() (in module apyt.reconstruction.basic) get_extended_cell_geometry() (in module apyt.analysis.chemistry.locomp) get_flight_correction() (in module apyt.spectrum.align) get_geometry_classic() (in module apyt.reconstruction.basic)

get_geometry_taper() (in module apyt.reconstruction.basic) get_margin_filter() (in module apyt.analysis.chemistry.locomp) get_mass_spectrum() (in module apyt.spectrum.align) get_query_points() (in module apyt.analysis.chemistry.locomp) get_setting() (in module apyt.io.config) get_voltage_correction() (in module apyt.spectrum.align)

L

lattice_vectors() (in module apyt.analysis.crystallography.sdm) load_config() (in module apyt.io.config)

load_record() (in module apyt.io.sql) login() (in module apyt.gui.forms)

M

map_ids() (in module apyt.spectrum.fit) mask_reconstruction (apyt.reconstruction.non_spherical.CurvatureReconstructor property) mask_tip (apyt.reconstruction.non_spherical.CurvatureReconstructor property) module apyt.analysis apyt.analysis.chemistry apyt.analysis.chemistry.locomp apyt.analysis.crystallography apyt.analysis.crystallography.sdm apyt.analysis.spectrum apyt.gui apyt.gui.forms apyt.io apyt.io.config apyt.io.conv apyt.io.localdb apyt.io.sql apyt.reconstruction apyt.reconstruction.basic apyt.reconstruction.non_spherical apyt.spectrum apyt.spectrum.align apyt.spectrum.fit

O

optimize_alignment() (in module apyt.analysis.crystallography.sdm)

optimize_correction() (in module apyt.spectrum.align)

P

peak_align() (in module apyt.spectrum.align)

peaks_list() (in module apyt.spectrum.fit)

Q

query() (in module apyt.io.localdb) (in module apyt.io.sql)

R

raw_to_ascii() (in module apyt.io.conv) rdf() (in module apyt.analysis.crystallography.sdm) rdf_1d() (in module apyt.analysis.crystallography.sdm) rdf_lateral() (in module apyt.analysis.crystallography.sdm)

reconstruct() (in module apyt.reconstruction.basic) reconstruct_height_profile() (apyt.reconstruction.non_spherical.CurvatureReconstructor method) reconstruct_positions() (apyt.reconstruction.non_spherical.CurvatureReconstructor method) rectify_sdm() (in module apyt.analysis.crystallography.sdm) rotate() (in module apyt.analysis.crystallography.sdm)

S

sdm() (in module apyt.analysis.crystallography.sdm)

spectrum() (in module apyt.spectrum.fit) split_molecules() (in module apyt.spectrum.fit)

T

tapsim_to_raw() (in module apyt.io.conv)

U

update() (in module apyt.io.localdb) (in module apyt.io.sql)

V

version() (in module apyt.spectrum.fit)

X

X_tip (apyt.reconstruction.non_spherical.CurvatureReconstructor property)

Y

Y_tip (apyt.reconstruction.non_spherical.CurvatureReconstructor property)

Ω

ω (apyt.reconstruction.non_spherical.CurvatureReconstructor property)